awk를 사용하여 여러 열을 콜론 기호로 연결하는 방법은 무엇입니까?

Anamaria

다음과 같은 파일이 있습니다.

head 1kG_MDS6.bim
1   rs2073813   0   753541  A   G
1   rs60320384  0   769223  G   C
1   rs59066358  0   771967  A   G
...

1, 4, 6, 5 번째 열 (순서대로)을 ":"로 구분하여 연결하고 싶습니다.

따라서 출력은 다음과 같습니다.

1:753541:G:A
1:769223:C:G
1:771967:G:A

나는 이것을 시도했다 :

awk ' { print $1 $4 $6 $5 ":" $NF } ' 1kG_MDS6.bim > 1kG_MDS6_SNPs1.txt

하지만 마지막 두 열만 ":"로 연결됩니다.

남자 이름

출력 필드 구분자를 사용하십시오.

awk 'BEGIN{OFS=":"} {print $1,$4,$6,$5}' file

산출:

1 : 753541 : G : A 
1 : 769223 : C : G 
1 : 771967 : G : A

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