我想在RHEL 6上安装ANARCI。我安装了Python 2.7.7。正如您可以阅读其主页一样，ANARCI需要Python 2.6+和HMMER3。我下载了anarci tar.gz，然后将其解压缩。与安装
python setup.py install --prefix=/tmp/anarci
但是当我运行时/tmp/anarci/bin/ANARCI -h，它没有显示名为ANARCI的模块。
在这种情况下，如何指定HMMER依赖关系。如何安装ANARCI？
谢谢回复。您的建议对我有用，唯一改变的地方是python之后，我必须将站点包附加到PYTHONPATH。
因此，导出PYTHONPATH = / tmp / anarci / lib / python / site-packages /：$ PYTHONPATH完成了这项工作。
在2017年5月29日星期一星期一下午6:53，邓巴，詹姆斯写道：嗨普拉珊特，
抱歉，回复缓慢。
anarci python模块需要位于您的PYTHONPATH env变量中，而hmmscan二进制文件（来自hmmer3）则位于PATH中。
例如，使用bash shell首先运行：
导出PYTHONPATH = / tmp / anarci / lib / python /：$ PYTHONPATH导出PATH = / tmp / HMMER-3.1 / binaries /：$ PATH
然后：/ tmp / anarci / bin / ANARCI
希望能有所帮助。如果您还有其他问题，请告诉我。
最好的，詹姆斯
詹姆斯·邓巴（James Dunbar）在2017年5月29日15:13写道：
----------转发的消息----------发件人：Prashant Shete <[email protected]>日期：2017年5月22日，20:18主题：抗体编号-ANARCI安装至：[email protected]
嗨，詹姆斯，
我试图从http://opig.stats.ox.ac.uk/webapps/sabdab-sabpred/ANARCI.php安装ANARCI
如它所说，它需要python 2.6+和HMMER3。我下载了anarci tar.gz，解压缩并在RHEL 6机器上运行python setup.py install --prefix = / tmp / anarci。
我还下载了HMMER-3.1，完成了安装，使用前缀/tmp/HMMER-3.1进行安装。
但是，当我运行/ tmp / anarci / bin / ANARCI时，它没有显示名为anarci的模块。是因为我还没有指定HMMER依赖关系，如果可以的话我该怎么做。
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